Sicherlich ist es schon vielen auf den Geist gegangen,
wenn der Ordner "Links" aus den Favoriten nicht zu löschen war.

Ein kleiner Trick löst das Problem:

Rufen Sie über das Kontextmenü die Eigenschaften von "Links" auf,
und setzen Sie das Attribut "Versteckt".

Nach dem Beenden und Neustarten des Internet Explorers
ist der Ordner nicht mehr sichtbar.